東大式 生命データサイエンス即戦力講座【電子版】
- 出版社
- 羊土社
- 電子版ISBN
- 電子版発売日
- 2021/12/10
- ページ数
- 344ページ
- 判型
- AB
- フォーマット
- PDF(パソコンへのダウンロード不可)
電子版販売価格:¥5,940 (本体¥5,400+税10%)
- 印刷版ISBN
- 978-4-7581-2117-0
- 印刷版発行年月
- 2021/11
- ご利用方法
- ダウンロード型配信サービス(買切型)
- 同時使用端末数
- 3
- 対応OS
-
iOS最新の2世代前まで / Android最新の2世代前まで
※コンテンツの使用にあたり、専用ビューアisho.jpが必要
※Androidは、Android2世代前の端末のうち、国内キャリア経由で販売されている端末(Xperia、GALAXY、AQUOS、ARROWS、Nexusなど)にて動作確認しています - 必要メモリ容量
- 34 MB以上
- ご利用方法
- アクセス型配信サービス(買切型)
- 同時使用端末数
- 1
※インターネット経由でのWEBブラウザによるアクセス参照
※導入・利用方法の詳細はこちら
この商品を買った人は、こんな商品も買っています。
概要
目次
第1章 Unix系環境の準備
1 環境構築のための計算機の準備
2 プラットフォームごとの環境の準備
第2章 データ解析に向けたUnix系環境の使い方
1 コマンドラインシェル(コマンドインタプリタ)
2 パッケージマネージャ
他
第3章 Pythonによるデータ解析の基礎
1 Pythonの起動と実行
第4章 Pythonによるデータ解析の実践
1 実践:matplotlibによるグラフの描画
2 実践:VCF形式ファイル内の変異の集計
第5章 R言語によるデータ解析の基礎と実践1
1 解析環境とRのインストール
2 パッケージのインストール
他
第6章 R言語によるデータ解析の実践2
1 実践:DEG解析
2 実践:階層的クラスタリング・ヒートマップ描画
他
第7章 スパコン利用のためのはじめの一歩
1 大規模計算機での解析
2 国内におけるスパコンについて
第二部 生命データサイエンスの実践
第1章 オミクス解析の準備
1 オミクス解析外観
2 オミクスシークエンス解析
他
第2章 ゲノム解析
1 実践:ゲノムシークエンスデータからの点変異の検出
2 その他のゲノム解析手法・ツールについて
第3章 トランスクリプトーム解析
1 実践:RNA-seqデータからの発現量算出とヒートマップ描画
第4章 エピゲノム解析
1 実践:ChIP-seqデータからのヒストン修飾のパターン解析
2 その他のエピゲノム解析手法
第5章 シングルセル解析1
1 実践:scRNA-seqデータの一次解析
2 実践:scATAC-seqデータの一次解析
[Column]計測技術の進展とデータ量
第6章 シングルセル解析2
1 実践:scRNA-seqデータからのクラスタリングと細胞種同定
2 実践:scATAC-seqデータからのクラスタリングとcoverageプロットの作成
他
第7章 ロングリード解析
1 実践:全長cDNA-seqデータからの発現量算出と短鎖RNA-seqデータとの比較
2 実践:長鎖ゲノムシークエンスデータからの構造変異の検出
他