空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド【電子版】
- 出版社
- 羊土社
- 電子版ISBN
- 電子版発売日
- 2022/12/08
- ページ数
- 244ページ
- 判型
- B5
- フォーマット
- PDF(パソコンへのダウンロード不可)
電子版販売価格:¥8,580 (本体¥7,800+税10%)
- 印刷版ISBN
- 978-4-7581-2261-0
- 印刷版発行年月
- 2022/12
- ご利用方法
- ダウンロード型配信サービス(買切型)
- 同時使用端末数
- 3
- 対応OS
-
iOS最新の2世代前まで / Android最新の2世代前まで
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※Androidは、Android2世代前の端末のうち、国内キャリア経由で販売されている端末(Xperia、GALAXY、AQUOS、ARROWS、Nexusなど)にて動作確認しています - 必要メモリ容量
- 34 MB以上
- ご利用方法
- アクセス型配信サービス(買切型)
- 同時使用端末数
- 1
※インターネット経由でのWEBブラウザによるアクセス参照
※導入・利用方法の詳細はこちら
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概要
目次
序―配列からバイオロジーへ
空間オミクス解析への期待
“使う”時代がやってきた
概論 空間オミクス解析の技術レビューと機器・データ解析ツール選択ガイド
◆実践編
第1章 技術とプロトコール
1 空間トランスクリプトーム Visiumによる新鮮凍結/FFPE組織検体の解析
2 空間トランスクリプトーム Visiumのデータ解析ツール
3 空間トランスクリプトーム ロングリードシークエンスを用いたscRNA-seqおよびVisiumの全cDNA解析
4 空間トランスクリプトーム 深層学習を活用したVisium測定結果の超解像度化
5 空間トランスクリプトーム Xenium In Situ
6 空間トランスクリプトーム HybISS(Hybridization-based in situ sequencing)
7 空間トランスクリプトーム Stereo-Seq(STOmics)
column ROI組織パンチングによる空間的遺伝子発現解析
column セミバルクRNA-seq
8 空間プロテオーム Hyperion Imaging Systemを用いた多重イメージングマスサイトメトリー
9 空間プロテオーム PhenoCyclerを用いた多重蛍光免疫染色
10 空間プロテオーム(空間トランスクリプトームも可能) GeoMxを用いたがん組織のマルチタンパク質発現解析
11 空間メタボローム メタボロームと時空間オミクスの融合とイメージングマス
第2章 データベース
12 バイオイメージングデータベースの現状と展望
13 遺伝子発現データベースを活用した空間・発生解析
◆応用研究編
第1章 発展的空間オミクス解析
1 空間オミクス解析を補う1細胞トランスクリプトーム技術の最前線
2 空間トランスクリプトームと1細胞トランスクリプトームの統合解析
3 空間トランスクリプトームに基づく細胞間相互作用ネットワークの解析技術
4 セルオミクスによる臓器・全身の空間コンテキスト解析
5 イメージングによるオミクス状態の推定
第2章 活用例と展望
6 免疫研究と空間オミクス解析
7 空間トランスクリプトームを用いた感染症研究の芽生え
8 心臓血管疾患と空間オミクス解析
9 がん免疫研究におけるシングル細胞解析と空間解析への展開
10 精神医学研究におけるゲノム解析と空間トランスクリプトームの現状
索引