序
本書の使い方
第1章 分子生物学実験器具・物品の取り扱い方
　1. 実験ノートと実験データ
　　1-1 実験ノートと実験データの重要性
　　1-2 実験ノートの書き方と保存方法
　　 COLUMN 実験を上手に行うために
　2. 実験器具（素材と基本的な使い方）
　　2-1 分子生物学実験関連器具の素材の特性
　　2-2 ガラス器具
　　 COLUMN 50mLの溶液Aを超純水で10倍希釈して500mLの溶液Bを作る時の注意点
　　 COLUMN 瓶のラベル
　　2-3 チューブ・プレート
　　 COLUMN 気密性の確認（蒸発テスト）
　　2-4 ピペット類
　　2-5 遠沈管・シャーレ・シリンジ・メンブレンフィルター・凍結保存用チューブ
　　2-6 その他
　　 COLUMN サンプルのラベル
　3. 実験器具の洗浄と滅菌
　　3-1 ガラス器具の洗浄
　　3-2 プラスチック器具の洗浄
　　 COLUMN 水の種類
　　3-3 オートクレーブ処理
　　3-4 乾熱滅菌処理
　4. RNAワークに用いる器具
　　4-1 ガラス器具（RNase freeのガラス器具）
　　4-2 プラスチック器具（RNase freeのプラスチック器具）
　5. 液体窒素
　　5-1 液体窒素の取り扱い
　　5-2 液体窒素によるサンプルの凍結
　6. 電子天秤
　　6-1 電子天秤の使い方
　7. pHメーター
　　7-1 pHを測る方法
　　7-2 pHメーターの使い方
　8. マイクロピペット
　　8-1 マイクロピペットとは
　　8-2 基本的な使い方
　　8-3 応用的な使い方
　　8-4 ピペット検定
　　 COLUMN マルチチャンネルピペットと電動マイクロピペット
　9. メスピペット
　　9-1 メスピペットの種類
　　9-2 メスピペットの選び方
　　9-3 メスピペットの使い方
　10. 分光光度計・微量分光光度計
　　10-1 分光光度計とは
　　10-2 使い方
　　10-3 微量分光光度計によるDNAやRNAの定量
　11. 遠心機
　　11-1 遠心機の種類
　　11-2 ローターの種類
　　11-3 遠心分離方法の種類
　　11-4 遠心力と回転数
　　11-5 遠心機の使い方
　12. シェーカー
　13. インキュベーター
　14. デジタルカメラ
第2章 試薬の調整方法
　1. 各種バッファーの特徴
　2. 各種バッファーの調整方法
　　2-1 Tris-HCl（1Mストック溶液）の作り方～濃塩酸で合わせる方法～
　　2-2 Trisバッファーの作り方～2種類の塩を混ぜて作る方法～
　　2-3 1M MOPS（pH7.4）の作り方
　　2-4 リン酸緩衝液（0.1M PB）の作り方
　　2-5 リン酸緩衝生理食塩水（10×PBS）の作り方
　3. その他のストック溶液や一般的な溶液の調整
　　3-1 5M NaCl
　　3-2 エタノール
　　3-3 5N 水酸化ナトリウム
　　3-4 0.5M EDTA
　　3-5 TE（Tris-EDTAバッファー）
　4. フェノール試薬の調整
　　4-1 酸性フェノールの作り方
　　4-2 中性フェノールの作り方
　　 COLUMN 簡易的な中性フェノールの調整
　5. クロロホルム，その他
　　5-1 クロロホルム（クロロホルム＋イソアミルアルコール：CIA）の作り方
　　5-2 フェノールクロロホルム（PCI）
　　5-3 1M 硫酸マグネシウム（MgSO₄）
　　5-4 3M 酢酸ナトリウム（NaOAc，pH5.2）
　　5-5 10mg/mL RNase A（DNase free）
　　5-6 20×SSC（3M NaCl-0.03M クエン酸ナトリウム，pH7.0）
　6. 試薬やサンプルの取り扱い・保存
　　 COLUMN 凍結サンプル・試薬の解凍
第3章 DNA/RNAの抽出
　1. サンプルの保存方法（DNA・RNA・タンパク質）
　　1-1 ラベリング
　　1-2 核酸の保存
　　 COLUMN RNA抽出前の組織のための“RNA保存液”の利用
　　1-3 タンパク質の保存
　2. 組み換え体の管理
　　2-1 カルタヘナ法
　　2-2 規制の対象
　　2-3 遺伝子組み換え生物などの使用
　　2-4 保管・輸送・譲渡
　　2-5 ゲノム編集技術で得られる生物の取り扱い
　　 COLUMN 大学連携バイオバックアッププロジェクト（IBBP）
　3. DNA/RNAの抽出作業
　　3-1 ホモジェナイズ
　　3-2 ホモジェナイズの方法
　　3-3 酵素によるDNA抽出（ゲノムDNA）
　　3-4 RNAを抽出する時のホモジェナイズ
　　3-5 シリカを用いた核酸精製の原理
　　3-6 カラムキットによるDNA/RNAの抽出
　　3-7 ビーズによるDNA/RNAの抽出
　　3-8 フェノール試薬を用いた抽出
　　3-9 エタノール試薬を用いた抽出
　　3-10 フェノールクロロホルムを用いた抽出試薬によるゲノムDNAの抽出
第4章 ゲノムデータベースの使い方
　1. Ensemblを用いたゲノムデータベースでの遺伝子の探し方
　　1-1 Ensemblとは
　　1-2 遺伝子の検索と検索結果の見方
　　1-3 実際に正しいかどうか系統樹を作ってみよう
　2. Blastによる遺伝子検索
　　2-1 ゲノムデータベースからのBlastによる遺伝子検索
　　2-2 ゲノムデータベースにおけるBlastの使い方
　3. Ensemblで予想cDNAや予想coding sequenceの塩基配列を取得する
　　3-1 イントロン・エキソン構造の表示
　　3-2 予測cDNA配列（transcript）を取得し，翻訳開始点を探す
　　3-3 種間比較
　　 COLUMN 便利なツール～配列取得から遺伝子系統樹作成，配列操作まで～
第5章 PCR
　1. PCRの原理と準備
　　1-1 PCRの原理
　　1-2 PCRの3つのステップ
　2. プライマー設計
　　2-1 プライマー設計とは
　　2-2 Tm値
　　 COLUMN Tm値の計算方法
　　2-3 GC含有率
　　2-4 プライマー設計で気を付けた方がよいことチェックリスト
　　2-5 ソフトウェアやウェブサイトを用いたプライマー設計
　3. 酵素の選択・エキソヌクレアーゼ活性・ホットスタート
　　3-1 酵素の選択
　　3-2 エキソヌクレアーゼ活性
　　3-3 TdT活性
　　3-4 ホットスタート
　4. PCRの基本プロトコル
　　4-1 試薬・温度条件
　5. 電気泳動
　　5-1 切り出し・定量（吸光度，蛍光）
　　5-2 ゲルの作り方・泳動
　　5-3 染色方法
　　 COLUMN アガロースゲルの先染め・後染めのメリット・デメリット
　　5-4 溶出方法
　　5-5 DNAの濃度の測定
　6. PCR・電気泳動のトラブルシューティング（2 step PCR，touch down PCR）
　　6-1 「目的の長さ」が増えない
　　6-2 収量が少ない
　　6-3 電気泳動したときのバンドが不明瞭
　　6-4 複数のバンドがみられる
　　6-5 電気泳動のバンドがゆがむ
第6章 シーケンス
　1. シーケンスの原理
　　1-1 ジデオキシ法（サンガーシーケンス法）の原理
　　1-2 プライマー設計時の注意点
　2. PCR産物からのシーケンスの準備
　　2-1 酵素を使う方法
　　 COLUMN 販売されているAlkaline Phosphatase
　　2-2 ビーズを使う方法（ビーズ精製）
　3. プラスミドのシーケンス
　　3-1 プラスミドのシーケンスの特徴
　　3-2 プライマー設計時の注意点
　　3-3 プライマー不要のサービス
　4. サイクルシーケンス反応
　　4-1 BigDye ^TMterminator v3.1を使用したシーケンス
索引
著者略歴