実験デザインからわかるCRISPRスクリーニング実践テキスト【電子版】

遺伝子探索の画期的手法として注目されるCRISPRスクリーニングを解説した，本邦初の実験書．基本フローと考え方のポイントから実際のプロトコールまで丁寧に解説され，開発者ならではのノウハウも満載です．

【目次】
序
概　論　CRISPRが一新した現代の遺伝子同定

第1章 基本フローと各フローにおける検討ポイント
1．CRISPRスクリーニングで最も重要な「数」を理解する
2．ゲノム編集手法～種類と選び方
3．Cas9発現マテリアルの準備
4．gRNAライブラリ：既製品と自作
5．変異細胞ライブラリの作製
6．表現型アッセイ
7．NGSサンプル調製とシークエンス
8．統計解析によるヒット遺伝子の同定

第2章 実践 基本プロトコール
1．レンチウイルスの基本操作―ウイルス作製と細胞への感染
2．Cas9レポーターアッセイ
3．gRNAライブラリの複製
4．フォーカスライブラリ自作と既存ライブラリ載せ替え
5．変異細胞ライブラリの作製とFitnessスクリーニング
6．選択圧によるスクリーニング
7．ソーターを使ったスクリーニング
8．NGSライブラリ作製
9．MAGeCKを用いたgRNAカウントデータの解析

第3章 実践 応用プロトコール
1．抗がん剤耐性・感受性因子の探索
2．ウイルスの増殖にかかわる宿主遺伝子の探索
3．がん免疫療法抵抗性にかかわる遺伝子の探索
4．ATAC-seeによるクロマチン・アクセシビリティ制御因子の探索
5．O-ClickFCを用いた脂質表現型スクリーニング
6．in vivoスクリーニングによる腫瘍免疫抑制因子の探索
7．精子機能を標的とするin vivo sgRNAライブラリスクリーニングの方法論

第4章 発展的な活用事例
1．スキャニングとしての利用：タンパク質機能ドメインの解析
2．遺伝子間の機能的相互作用を狙ったCRISPRスクリーニング
3．アレイ型CRISPRスクリーニング
4．DepMapデータを用いたがん治療標的因子の探索
5．シングルセル解析とCRISPRスクリーニングの融合

索引