≪実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ≫
AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド【電子版】
今日からできる!構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで
- 出版社名
- 羊土社
- 発行年月
- 電子版発売日
- ページ数
- 216ページ
- 判型
- B5
- 印刷版ISBN
- 978-4-7581-2276-4
- 電子版ISBN
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概要
2024年ノーベル化学賞のテーマ「AlphaFold」を扱う本邦初の実験書.どのツールをどう使えばいいか,実践的な解説が満載.本書を片手にタンパク質の「構造」から機能を探り,研究を一つ上のステージへ
目次
【目次】
序
第1章 概論と基礎知識
1 構造バイオインフォマティクスへの招待
2 AlphaFold2の衝撃
3 AlphaFoldの予測構造を読み解くための基礎知識
第2章 立体構造データの入手と可視化・簡易計測
1 立体構造データの可視化と解析のためのツール
2 各種立体構造データベースの種類と使い方
3 タンパク質の立体構造予測 ColabFoldとAlphaFold2
第3章 立体構造によるタンパク質の機能推定
1 タンパク質 タンパク質の相互作用予測 AlphaFold-MultimerとAlphaFold3
2 分子ドッキング法 タンパク質 化合物複合体の構造予測
3 MDシミュレーション 予測構造モデルの安定性や結合の強さを検証する
4 構造比較 立体構造を検索して比較する
第4章 応用・発展的研究
1 タンパク質の構造変化予測 AlphaFoldと分子動力学の統合
2 タンパク質デザインAIの動向と利用のコツ
3 AlphaMissenseによる変異導入効果予測 タンパク質言語モデルと立体構造予測の融合
索引
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