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≪実験医学別冊≫

改訂 独習Pythonバイオ情報解析【電子版】

生成AI時代に活きるJupyter、NumPy、pandas、Matplotlib、Scanpyの基礎を身につけ、シングルセル、RNA-Seqデータ解析を自分の手で

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム (編)

出版社
羊土社
電子版ISBN
 
電子版発売日
2025/02/05
ページ数
446ページ
 判型
AB
フォーマット
PDF(パソコンへのダウンロード不可)

電子版販売価格:¥7,150 (本体¥6,500+税10%)

印刷版ISBN
978-4-7581-2278-8
印刷版発行年月
2025/01
ご利用方法
ダウンロード型配信サービス(買切型)
同時使用端末数
3
対応OS
iOS最新の2世代前まで / Android最新の2世代前まで
※コンテンツの使用にあたり、専用ビューアisho.jpが必要
※Androidは、Android2世代前の端末のうち、国内キャリア経由で販売されている端末(Xperia、GALAXY、AQUOS、ARROWS、Nexusなど)にて動作確認しています
必要メモリ容量
76 MB以上
ご利用方法
アクセス型配信サービス(買切型)
同時使用端末数
1
※インターネット経由でのWEBブラウザによるアクセス参照
※導入・利用方法の詳細はこちら

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概要

Pythonの定番テキストが待望の改訂!大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から,シングルセル,RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます.サンプルデータとコード見本付きで,今日から実践しながら学べます.改訂では,生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し,各種ライブラリのアップデートに対応しました.

目次

【目次】
改訂にあたり
はじめに(初版)

第1章 この本の使い方と事前準備
第2章 生成AIを用いたプログラミング
第3章 Jupyter Notebookの使い方
第4章 Python速習コース
第5章 文字列処理の基本 ファイルの読み書き,正規表現
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 オブジェクト指向入門
第7章 pandasはじめの一歩 表形式データの扱い方
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 pandas実践編
第9章 データの可視化 Matplotlib,Seabornを用いたグラフ作成
第10章 統計的仮説検定 RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで
第11章 シングルセル解析(1) テーブルデータの前処理
第12章 シングルセル解析(2) 次元削減
第13章 シングルセル解析(3) クラスタリング

付録A NumPy入門
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析

索引
執筆者一覧